Hay scripts php/mysql para eso pagos , como por ejemplo
www.in-link.net , también hay uno gratuito, que es este, y esta en español :
Cita: El GoldLink es la herramienta ideal para la administración, promoción y ordenamiento de hipervínculos.
Utiliza un sistema de deudas para el posicionamiento de un listado de enlaces, con el fin de ser mostrados en un sitio web.
A diferencia de otros gestores de intercambios de enlace, el concepto que emplea GoldLink para el listado, es el de Deudas de visitas recibidas, aunque también puede ser configurado para posicionar los enlaces por visitas entrantes (HitsIN).
Mas info en :
http://www.goldscripts.com/goldlink.php