Si quieres conocer más sobre PHP-GTK .. en este foro de PHP tienes un sub-foro de PHP-GTK donde se tratan esos temas, dispone de sus própias FAQ's donde tienes links de interes .. partiendo por la documentación oficial:
http://gtk.php.net
Ahora .. la pregunta sería:
¿si tu aplicación es "de escritorio" ..? por qué usas PHP? .. No te sería mejor usar Visual Basic, C++, Delphi (lenguajes compilados)...?. O en su defecto PHP-GTK que por lo menos aunque sea todavía "interpretado" .. si tienes PC's corriendo en WIndows y Linux no tendrás problemas en portar tu aplicación.
Creo que tendrías que evaluar mejor tu situación .. Aunque uno se muy "fanatico" de cierto lenguaje (es mi caso por ejemplo) también hay que comprender que cada lenguaje es para cada caso.
Un saludo,