Deberías poner el código que usas . .ya que estás hablado de N scripts .. con iframes y recargas de estos ..
Pero "al parecer" podrías tener problemas de caché de tu navegador .. Prueba a eliminar dicho caché en tus páginas (scripts) al principio de estos usa:
Código PHP:
<?php
// Date in the past
header("Expires: Mon, 26 Jul 1997 05:00:00 GMT");
// always modified
header("Last-Modified: " . gmdate("D, d M Y H:i:s") . " GMT");
// HTTP/1.1
header("Cache-Control: no-store, no-cache, must-revalidate");
header("Cache-Control: post-check=0, pre-check=0", false);
// HTTP/1.0
header("Pragma: no-cache");
?>
Un saludo,