El problema en si no radica donde están los index, sino q configuración tienes en el httpd.conf en la carpeta conf de la instalación de apache.
Código PHP:
DocumentRoot "G:/Apache/htdocs"
Esa es mi configuración, fijate las barras, puede ser eso si estas bajo windows, bajo linux serían invertidas y sin el G:.
Además busca esta línea
Código PHP:
<IfModule mod_dir.c>
DirectoryIndex index.php index.html index.htm index.php3
</IfModule>
En esa línea debes de poner los index (o como quieres q se llamen los archivos q apache buscará para mostrar).
Saludos cuidate