Hola
No te preocupes a todos nos pasa, casi siempre se debe a que el IE :-p es probablemente el navegador que menos respeta las especificaciones del w3c
ni modo vas a tener que ingeniartelas como todos, para lograr que se vea decente en cualquier navegador web pero te recomiendo que pongas dudas especificas para que te podamos ayudar.
Hasta pronto
