Sobre atributos de carpetas y archivos...

[Herminio Heredia San]

Cuando tu crear un archivo o carpeta mediante un script de php los permisos del due~o de ese archivo son seteados al usuario que esta corriendo el servidor de http, que en servidores *NIX puede ser nobody, web o algun otro.
Bien lo que pasa con esto es que cuando tu intentes borrar los archivos desde rl ftp por ejemplo te va a marcar error por que tu no eres el propietario del archivo.
Asi que lo que puedes hacer es crearte una aplicacion para que desde php borres esos archivos o que cuando los crees uses la funcion chown para setear como propietario del archivo tu nombre de usuario.
O setear permisos a 0666.

Saludos.