Hola,
Desde hace tiempo tenia el problema de pasar ciertos videos en formato Moeg a .Mov, para que se pudieran editar, trabajo algo complicado porque en algunos editores de audio al importar mpeg el audio desaparece, por fin encontre este software (Mac) que se llama QuickMix y que se encuentra en el siguiente link,
http://www.smileyhappysw.com/.
Sólo hay que importar el video en Mpeg y viene la opcion de "guardar como Movie (mov)"
Realmente me ayudo mucho, espero que les ayude a varios mas.
Saludos.