Sí... pero no así.
PHP trabaja del lado del servidor por lo que para ejecutarlo (hacer tu consulta) tendrás que recargar la página al menos... Entonces podrás pasar tu valor JS por URL y recojerlo con $_GET para posteriormente aplicarlo en tu consulta...
Por ejemplo, si creas con JS una URL
pagina.php?var=valor podrás hacer:
Código PHP:
$result = mysql_query("SELECT * FROM paciente WHERE nombre LIKE '".$_GET['var']."'", $link);
Entonces.. tu problema se remite a cómo hacer para construir esa URL... pero ya es tema de JS...
Ahora bien... quizá quieras evitar el efecto de racargar la página... bien podrías usar iframes... mandar a abrir un iframe que es donde se hará tu consulta. Algo más complejo son los métodos de AJAX y JSRS ... dale una buscada en este foro por si te interezan... repito: todo esto para "evitar" el recargar la página.
Suerte!
