La sulución más "transparente" para tu código y segura sería usar SSL (Secure Socket Layer) .. así todo dato entre tu cliente (navegador) y servidor (donde están tus páginas/scripts PHP) será encriptado.
Si quieres, puedes liarte con MD5() en javascript .. algo más "seguro" será tu sistema ante un "sniffer" en una red (alguien que esté capturando tus datos entre cliente-servidor) ..
Cita: Lei anteriormente que la mejor manera de autentificar seria utilizando encode para codificar y md5 para la conversion. Es eso cierto?? encode esta ya obsoleto, seria base64_encode su sustituto?? Como funcionaria esta manera de encriptar??
La diferencia es que base64_xxx() no es una función para "encriptar" sino para "codificar" que es bien distinto .. de hecho, base64 tiene su "_encode()" y su _decode .. MD5() por el contrario es un algorítmo de encriptación de un sólo sentido (no se puede desencriptar "hash").
Un saludo,