Si tu DVD es de los que reproducen AVI, pues lo grabas poniendo a ambos archivos el mismo nombre, salvo la extensión, por ejemplo:
pelicula.avi
pelicula.srt
Si tu DVD soporta subtitulos, te los cargará o te dará la posibilidad de cargarlos. Si no los soporta, no puedes hacerlo... a menos que los pegues de forma definitiva a la imagen:
www.mundodivx.com/subtitulos/avi.php
Saludos