ten en cuenta que los check boxes no pasan ningun valor en si, simplemente se pasan o no: Si nbo lo han marcado, pasara como vacio, si esta marcado, no estara vacio.
lo que tienes que hacer es usar (por ejemplo) la funcion EMPTY:
Código PHP:
//primerohaces el get
$check1=$_get['nombredelchkbox'];
//y despues
if(!empty($check1))
{$valorchk=1;}
else
{$valorchk=0;}
despues metes en las tablas con el INSERT los valores que tu le has dado, $valorchk, en este ejemplo