Lo ideal aquí es que comprimas un poquito más tu peli, con algún programa de edición de video, pero ya sabes el tortuoso y lento proceso que es eso. No se si haya algún programa para hacer esto de una manera más sencilla.
Así de momento es lo que tengo. Pero sigo buscando.
Con qué codec creaste tu pelí, quizá lo puedas cambiar por un Xvid.
Saludos!