Lo único que tienes que hacer es:
cuando recibes la variable ($contenido) con todo el contenido del textarea y te dispones a introducirla en tu base de datos,
Código PHP:
$contenido=$_POST['contenido'];
$contenido=nl2br($contenido);
//introduces $contenido en la base de datos...
Creo que esto será suficiente (¡que alguien me corrija si me equivoco!).
Saludos,