Hola,
haber si entiendo, tienes un codigo php grabado como cadena en la BD y al obtenerlo quieres tratarlo como php y no como cadena? si es asi debes evaluarlo, es decir eval($tucadena) asi tratas esa cadena como expresion php
visita te puede servir:
http://www.php.net/manual/es/function.eval.php
suerte y saludos