Si, eso ya se puso algo misterioso, pero prueba lo siguiente:
En el httpd.conf puedes intentar cargar el modulo de php de esta otra forma.
LoadModule php5_module "c:/php/php5apache2.dll"
ScriptAlias /php/ "c:/php/"
AddType application/x-httpd-php .php
Action application/x-httpd-php "/php/php.exe"
Esta puede ser la solucion
PD: Oye, tambien cada que cambias algo en php.ini lo copias a c:/windows ?
Saludos