asi es, verifica la URL de la pelicula
generalmente programas como Dreamweaver te ponen URL's de tipo absolutas "FILE://c:/carpetax/mascarpetas/animacion.swf" y cuando mueves de directorio tu web, deja de funcionar correctamente, es por eso que ami me gusta mas hacer el HTML a pincel
anyway, el caso es que revises bien la URL de la pelicula y la hagas "relativa"!!
have funn