¿Seguro que la coge del calendario asi "2005/13/9" y no asi "2005/9/13"? Lo logico seria que te la cogiera de la segunda forma y entonces para pasarla a formato "13/09/2005" harias:
Código PHP:
// Con esto pasas la fecha a marca de tiempo que es un
// numero entero que representa a la fecha
$fecha = strtotime("2005/9/13");
// Asi le das formato a la fecha
$fecha_buena = date ("d/m/Y",$fecha);
echo $fecha_buena;
Mirate todas las opciones del date en:
http://php.grn.es/manual/es/function.date.php