Yo esa manera sí la veo bien
Pero no la he probado, yo actualizo de otra forma, con el archivo patch y haciendo los cambios como si se tratara de un mod:
Actualizar phpBB 2.0.11 a 2.0.17 pero con una chat en la misma BD
Lo hago así pq tengo muchos mods instalados y volver a modificar todos los archivos es un coñazo. Con el patch simplemente hago los cambios de una versión a otra del foro, dejando los mods como estaban.
Por otro lado también tengo un servidor de pruebas instalado en mi ordenador, con una copia del foro y la web, y ahí pruebo todo antes de subirlo a la red, así si hay fallos puedo corregirlos... te recomendaría que te instalaras uno:
http://www.maestrosdelweb.com/editorial/phpmysqlap/
Un saludo