Yo también te recomiendo NTFS por el mismo motivo
No te hace falta formatear
Si no tienes el partition magic, puedes hacerlo abriendo una ventana de comandos y escribiendo:
convert C: /fs:ntfs
Siendo C: el nombre de la unidad que quieres convertir. Al reiniciar, se convertirá la unidad sin perder la información
Un saludo
