Un ejemplo de código para lo que tu pretendes es:
Código PHP:
$contenido = '<?
$variable1='si\';
$variable2=\''.$variable2.'\';
?>';
$archivo="archivo.php";
$fp=fopen($archivo,'w+');
fwrite($fp,$contenido);
fclose($fp);
Espero que te sirva. ¡Si no entiendes algo pregunta!
Saludos,