Ok .. ioncube tiene sus versiones de evaluación (así dice:
www.ioncube.com).
Tendrías que ver bien que tipo de licencia es "freeware" .. dicha licencia no dice que el código deba ser "abierto", sólo la distribución y uso de ese software es libre. No obstante lo mejor es que consultes a su autor y el te aclarará ese tema si quieres disponer de su código. (me refiero a la aplicación encriptada con ioncube)
De todas maneras no está de más recordar las normas del foro (yo no sé si tus las conoces .. para eso estamos .. para recordarlo por si acaso).
Un saludo,