A grandes rasgos .. CHMOD es el sistema de permisos que que tiene un fichero en un sitema *NIX (Unix, Linux, freeBSD ...).
Estos permisos son acerca de las acciones que se pueden realizar sobre ellos .. como: leer, escribir, y ejecutar ... tambien se le dan permisos sobre quien pude realizar estas acciones como: el propietario (el que creo el fichero) o grupo (que pertenece a ese grupo) ... (creo q me dejo uno xD?).
Un saludo, espero que te quede claro ..