Pués si solo te intereza ese dato en efecto, una función de cadena te será útil: substr():
Código PHP:
$fecha= "2005-09-29"; // en tu código mencionas así es el formato
echo substr($fecha, 2, 4);
... igual deberías especificar de dónde y cómo es que recibes el dato para qué vaz a emplearlo posteriormente (si se puede saber, claro...) para poder plantearse otras soluciones.