No se trata de un problema con los gifs... solo se paran cuando desde un enlace en la pagina padre abro una ventana popup... se paran absolutamente todos los gifs animados de la pagina padre y para que funcionen de nuevo he de "refrescarla".
En fin, gracias...
<center><img src="http://www.itecsi.com/jesus/firm.gif" border=0></center>