A mí me pasó exactamente eso, es porque si ejecutas exactamente el codigo del ejemplo estás cargando el ejemplo como tal y no tu gráfica.
Esto es por los includes que tienes:
Código PHP:
include ("jpgraph.php");
include ("jpgraph_pie.php");
include ("jpgraph_pie3d.php");
Estos includes deben ser a los archivos .php que están en la carpeta src de la libreria.
algo como:
Código PHP:
include ("src/jpgraph.php");
O como tengas tu direccionamiento.
Saludos.