Cita: home.php que codigo debe de ir ahi o simplemente hago un php en blanco?
lo que quieras!. según entiendo ese código (pensé que tú lo habías escrito) esta pensado para que home.php sea, propiamente, tu página de inicio, el default, el "verdadero index". No es otro archivo más que incluir, así como lo es 001.php ó error.php, todo depende de "las circuntancias" que se den (traduscase: de qué condiciones se cumplan).
... los enlaces iniciales (FAQ, artículos), tienes toda la teoría y mucho código.