Hola
tonin!
Tienes que crear un objeto en base a la clase fpdf.
Código PHP:
$Obj = new FPDF();
Ya creado tu objeto puedes usar los métodos y propiedades miembro. Los resultados de tu facturación debes generarlos con la utilización de esos métodos, puedes leer mas del uso de la clase en este link
http://www.fpdf.org/en/tutorial/index.php y en este otro
http://www.fpdf.org/en/doc/index.php esta la explicación de todos los métodos.
Suerte!