Si ya tienes tu script PHP que genera tu PDF .. algo tipo genera_pdf.php .. arma un frame-set o un iframe, dale dimensiones y ahí en el "src" llama a tu script de proceso que genera el PDF.
EL "Iframe" o "frame" es un "tag" de HTML .. revisa algún manual de HTML si tienes más dudas ..
Por ejemplo (con un iframe):
Código PHP:
<html>
<head>
</head>
<body>
Archivo PDF
<P ALIGN=center><IFRAME SRC="genera_pdf.pdf" WIDTH=300 HEIGHT=100></IFRAME></P>
</body>
</html>
http://www.htmlhelp.com/reference/ht...al/iframe.html
Un saludo,