Todo depende si tienes acceso a la configuración de tu servidor.
Si es así .. lee esta FAQ al respecto.
http://www.forosdelweb.com/showpost....&postcount=146
También te hará falta aumentar el tiempo de ejecución de tus scripts PHP que será probable (depende de la conexión entre tu cliente-servidor) que supere el tiempo máximo que PHP le dá para ejecución a todos los scripts.
set_time_limit()
www.php.net/set_time_limit
Un saludo,