Si usas Linux como SO en el servidor y tienes los usuarios en una base de datos tienes que instalar un modulo de apache (si no viene con tu distribución) que se llama mod_auth_mysql. Para configurarlo te remito a
<a href='ir.asp?http://www.serveurs.net/fr/aide/generale/mod_auth_mysql.html' target='_blank'>http://www.serveurs.net/fr/aide/generale...</a>
Lo explica para win pero es valido (la configuración) para Linux.