Lo que debes fijarte desde ahora (una vez ya instalado por médio de algún instalador como "WAMP Server") es en las versiones de lo que instalates.
Si hablas de Msyql .. fijate que versión instaló tu "WAMP" .. por qué los procedimientos almacenados (Store procedure) sólo los puedes usar desde Mysql versión 5.0 en adelante.
También fijate que NO todo servicio de hosting usa Mysql versión 5.x en adelante (muchos todavía están en Mysql 4.0 y a lo sumo Mysql 4.1.x). Esto es bien importante .. por qué de nada te servirá tener en "casa" Msyql 5.x y usar "Store procedure" para luego subir todo a un servidor con una versión de Mysql muy inferior a esta.
http://dev.mysql.com/doc/mysql/en/st...rocedures.html
Sobre si phpMyadmin puede gestionar Procedimientos Almacenados, no sé desde que versión de phpMyadmin soporta Mysql 5.x .. pero por lo menos la última lo soporta (o así dice la documentación).
Si usas Windows y quieres probar otros GUI's para Msyql .. puedes ver:
Navicat
www.navicat.com
(es comercial, pero con mejoras sustanciales, ... igualmente gestiona Store procedures).
Un saludo,