Si lo hice, mi error era bastante torpe
Código PHP:
SELECT `title`, `url`, `desc`, `keys`, MATCH(`desc`,`keys`) AGAINST('$var' IN BOOLEAN MODE) AS `Score` FROM `db` WHERE MATCH(`desc`,`keys`) AGAINST('$var' IN BOOLEAN MODE) AND `state` = 1 ORDER BY `pts` DESC, `Score` DESC
El problema era que estaba usando "IN BOOLEAN MODE" SOLO en el primer AGAINST(), entonces no me lo estaba tomando...