Luego de probar varios códigos, he aquí la solucion. Ojalá a alguien le sirva:
Gracias a todos.
Código PHP:
//ASIGNACION DE VALOR A LA LETRA QUE IDENTIFICA LA CARRERA
if ($carrera==1)
{
$letra="A";
}else{
if ($carrera==2)
{
$letra="E";
}else{
$letra="D";
}
}
//VARIABLES PARA COMPLETAR CON CEROS A LA IZQUERDA DEL NUMERO
$seisceros="000000";
$cincoceros="00000";
$cuatroceros="0000";
$tresceros="000";
$dosceros="00";
$uncero="0";
//CONEXION CON LA BASE DE DATOS
conectar_admin('sga');
//DEFINICION DE SENTENCIAS SQL DE BUSQUEDA DE PARTE NUMERICA SEGUN LA IDENTIFICACION DE CARRERA ($letra)
$busca="select count(cod_alumno) as encontro from datos_personales_alumnos where LEFT(cod_alumno,1) = '$letra'";
$id=mysql_query($busca);
$data = mysql_fetch_array($id);
//CAPTURA DEL RESULTADO DE CONSULTA SQL E INCREMENTO
$final= $data[encontro] + 1;
//SENTENCIA SWITCH PARA LA ASIGNACION FINAL DEL NUMERO DE LEGAJO LETRA+CEROS+NUMERO
$caracteres = strlen("$final");
switch ($caracteres)
{
case 1:
$cod_alumno="$letra$seisceros$final";
break;
case 2:
$cod_alumno="$letra$cincoceros$final";
break;
case 3:
$cod_alumno="$letra$cuatroceros$final";
break;
case 4:
$cod_alumno="$letra$tresceros$final";
break;
case 5:
$cod_alumno="$letra$dosceros$final";
break;
case 6:
$cod_alumno="$letra$uncero$final";
break;
}
//CIERRE DE CONEXION CON LA BASE DE DATOS
mysql_close();