Pueden ver como interactuar con PHP y LDAP en:
www.php.net/ldap
(se requiere en PHP soporte (extensión) para LDAP. Hay muchos comentarios de interes sobre LDAP y afines por parte de los usuarios).
Se trata de que windows autentifique con un servidor LDAP (standar o el Active Directory)
Por google apareció esta classe para tal fin:
http://adldap.sourceforge.net/
Un saludo,