Todo dentro del mismo parentesis:
Código PHP:
if($_FILES['download']['type']=="image/gif" || $_FILES['download']['type']=="image/gif")
O agrupando condiciones:
Código PHP:
if(($_FILES['download']['type']=="image/gif") || ($_FILES['download']['type']=="image/gif"))
Siempre la/las condiciones van dentro de los paréntesis de la estrucutra if. Dentro de ella puedes agruparlas como puse en el 2º ejemplo.
Saludos.