Supongo (no lo concretas bien) que usas un formulario de "upload" de archivos .. con su campo "file" y un script de proceso PHP para recibir el archivo ..
Creo que ya conoceras que en $_FILES['archivo']['type'] tienes el formato MIME del archivo que sube (para que puedas aplicar tus IF() o switch() .. o "in_array()" ...)
Lo recomenable sería que crees un array con los formatos MIME que quieres aceptar y usas in_array() para ver si tu $_FILES['archivo']['type'] están entre ellos para aceptarlo o no ..
Lo único que te hará falta saber es que formatos MIME son los que corresponde a las aplicaciones que mencionas.
Por ejemplo .. por aquí podrías verlos
http://www.iana.org/assignments/media-types/ Cita: x cierto, uso phpmailer, el servidor de correo tengo total acceso ya q es interno en la empresa, tambien tengo un antivirus y un antispam dedicado al correo... pero me gustaria poder depurar esa parte para evitar algun susto, ya q el correo va a una cuenta ajena a mi departamento... y los usuarios son un peligro!
Eso tendrás que concretarlo en el foro de "Seguridad y redes" .. no sé a que te refieres con "susto" .. pero seguramente por ese foro te podrán dar algunos "tips" básicos de seguridad al respecto; algunos tal vez ya los has tenido en cuenta y otros no.
Un saludo,