Por casualidad viendo la documentación oficial de PHP sobre PDF Lib .. ví en los comentarios de los usuarios unas propuestas de "pfd2txt" hechas en PHP sólo; interpreta el "psudo" código que genera un PDF. No sé si funcionará con todo tipo de PDF ni como andará de "rendimiento" si hay un PDF extenso .. pero por lo menos algo deberían hacer.
http://www.php.net/pdf
Un saludo,