Ningún problema.
De hecho esa es la forma en la que se desarrollan muchas aplicaciones en PHP y lo hacen así:
En cada una de sus páginas, insertan con un include a la librería de funciones:
include("f/funciones.php");
Con eso evitan estar llamando a muchos includes, pues
funciones.php se compone más o menos así:
Código PHP:
//
include_once("funciones_database.php");
include_once("funciones_print.php");
include_once("funciones_fecha.php");
//etc, etc.
Y cada uno de esos archivos está conformado por funciones o bien, ¡más archivos! Así, no necesitas llamarlos a todos en tus scripts, nada más llamas a uno, que a su vez, se encarga de llamar a otros y éstos a su vez, a otros...
Además de lo ordenado que resulta, pues todo está dentro de una carpeta llamada
f y mantienes todo ordenado. Por eso al llamar a funciones.php se usó
include("f/funciones.php");, pero no en las demás, pues funciones.php (que ya está dentro de la carpeta
f), es la que llama a las otras.
Espero no haberte confundido, ahorita que volví a leer lo que escribí se ve medio confuso el ejemplo.