Por ssh, desde consola (Linux). Para windows, configurar WinScp (
https://sourceforge.net/projects/winscp/):
Código:
para logearse en el servidor
# ssh usuario@ip_server
password: colocar_password
//dejamos toda info en un archivo tar
server # tar -cf archivo_destino.tar ruta/datos
//comprimimos con bzip2
server # bzip2 archivo.tar
//salimos del servidor
server # exit
//bajamos el archivo a nuestro pc
# scp usuario@ip_server:archivo.tar.bz2 .