Prueba de esta manera:
Código PHP:
<?
$res=mysql_query('select id,url from trabajos');
while($fila=mysql_fetch_array($res))
{
$url = $fila['url'];
echo '<p style="margin-top: 0; margin-bottom: 0"><b>';
echo '<font face="Arial" color="#808080" style="font-size: 9pt">';
echo "<a href=\"$url\">";
echo $url;
echo "</a>";
echo '</font></b></p>';
}
?>
En la línea
echo "<a href=\"$url\">";
tenés que usar comillas dobles para que el se imprima el contenido de la variable $url, si usas comillas simples se imprimiria textualmente <a href="$url">.
Saludos.