Hola,
Hace un tiempo buscaba lo mismo y no sabía nada de PHP. Encontré este manual del ForoCreativo, que me fue muy util.
Te explico: vos pones en el index por ejemplo, que todos los enlaces vayan a una pagina en la que dice "Debes registrarte para ingresar a esta seccion". Entonces cuando se registran, y se loguean en tu sitio, acceden a un index IDÉNTICO pero que los enlaces están bien, y te permite ingresar a todo. No es algo muy seguro, sólo es para forzar a los usuarios a que se registren.
En el caso de que supieran la dirección DIRECTA de la página, ahi podría entrar sin problemas. Digamos que es como un engaño, pero la persona deberá registrarse para poder ingresar a esas secciones.
Si no entiendes bien, detallame lo que no entendés porque de principiante este tutorial me ayudó mucho y la verdad es que también tuve mucho lugar a dudas.
Más que nada por el vocabulario, si sos muy principiante te podés perder.
Los archivos PHP que te solicita los hacés con el bloc de notas, pero los guardás con extensión PHP (cuando vs a guardar, elegís: TIPO-> Todos los archivos, y el nombre xxx.php) y te queda como PHP.
¿Qué programa estas utilizando para hacer tu sitio?
El tutorial podés verlo haciendo clic aqui --->
*Tutorial* Espero que te sea de utilidad, Slaouds