La calidad la afectas al exportar, si exportas con buena calidad el resultado es un video editado con las mismas propiedades del original, o en un formato más grande, por ejemplo para DVD (si un video tiene "x" calidad, es dificil mejorarla, así que solo se puede mantener esa misma calidad).
Entonces, si editas y exportas a un buen formato, no debes tener mayor problema, auqnue lo ideal es guardar como respaldo los originales, uno nunca sabe.