A ver si cambiando
Código PHP:
if (mysql_num_rows($result)) { ?>
<script language="JavaScript" type="text/javascript">
var cadena = "<?php echo "El paciente ".$row['iniciales']." ya esta registrado"; ?>";
alert(cadena);
</script>
<?
mysql_free_result($result);
} else{
por
Código PHP:
if (mysql_num_rows($result)!=0) { ?>
<script language="JavaScript" type="text/javascript">
var cadena = "<?php echo "El paciente ".$row['iniciales']." ya esta registrado"; ?>";
alert(cadena);
</script>
<?
mysql_free_result($result);
} else{
A ver si asi.
Saludos.:Adios: