Se puede hacer y como dice omar1977 hay que tener en cuenta los valores entre comillas, particularmente cuando tengo que escribir algo de javascript desde php utilizo
heredoc, usando heredoc puedes escribir HTML sin problema alguno incluso usar variables de php.
echo <<<EOT
<script>
alert('Javascript desde PHP');
alert('$variable_de_php');
</script>
EOT;
eso si, la última línea siempre debe estar al lado izquierdo del editor, sin espacios o tabulaciones.
