Podés utilizar una consulta como esta:
Código PHP:
<?
...
$consulta = "SELECT link, count(id) cuenta FROM click GROUP BY link ORDER BY cuenta DESC";
$resultado = mysql_query($consulta);
...
?>
Esa consulta te va a dar una tabla con dos campos (link y cuenta) que indica la cantidad de registros que había en tu tabla link para cada link. La tabla va a estar ordenada de mayor a menor segun el campo cuenta.
Saludos.