Free (open source) software which supports or uses LAME:
http://lame.sourceforge.net/links.html
De esa enorme lista de programas yo uso, en windows, el Razor Lame:
http://www.dors.de/razorlame/index.php
También tengo el Audacity (Open source multiplatform audio editor:
http://audacity.sourceforge.net/ ), pero, para pasar a mp3, uso, como te decía, el Razor.
En fin, sea como sea, con el primer enlace creo que tienes más de lo que buscabas.
Edición: Te recomiendo instalar, antes de nada, los encoders de mp3 (muchos programas de audio que tengas ahora (o en el futuro) los usarán si los tienes instalados con independencia de otros programas de terceros). Tanto el encoder LAME 3.94 para windows como otros encoders de mp3 puedes descargarlos desde el menú encoders (frame izquierda) del sitio
http://www.mp3-tech.org/