Para hacer ese cálculo tendrías que tener las fechas como timestamp. No so como las estaras guardando en tu base de datos, pero con la función
strtotime() podés convertir una fecha en formato textual a timestamp. Luego tendrias que realizar la resta y por último darle el formato que prefieras con
date():
Código PHP:
<?
$fecha1 = "una_fecha";
$fecha2 = "otra_fecha";
$resta_fecha = strtotime($fecha1) - strtotime($fecha2);
echo date("d-m-Y", $resta_fecha); //Imprime la fecha con formato dd-mm-aaaa
?>