De la página oficial
http://www.tmpgenc.net/e_main.html
De preferencia debes tenerlas en mpeg-1, el TMPGENc te las converte, al igual que otros programas como Canopus. este último te permite bajar el bitrate para hacer que quepa en el disco
Si las tienes en mpg-? el nero puede hacer la conversión, pero puede ser algo lento e inestable.
Yo uso la versión 6 y no me da problemas.