Por lo que entiendo tu provlema esta en la recepcion de los textboxes, hace algun tiempo tuve un problema similar, revisa el siguiente POST a ver si te puede ayudar, ademas tiene los textboxes de marcar y desmarcar todos,
http://www.forosdelweb.com/f13/checkboxes-php-javascript-323861/
Espero que te sirva de algo.
Saludos.
