Lo puedes hacer de varias maneras, la mas comun mundialmente es PayPal (
www.paypal.com) que te permite cobrar con tarjeta de credito y el dinero te quedara almanecenado en tu cuenta electronica. Al mismo tiempo tu tendras una tarjeta de credito o cuenta bancaria para retirar ese dinero electronico desde un Cajero Automatico o a tu cuenta bancaria.
Esa la forma mas comun y sirve para cobrar en casi cualquier lugar del mundo.
En Mexico, como en muchos paises tipo España, USA, etc hay bancos locales que permiten realizar el cobro a traves de ellos. Esto suele ser mas confiable para personas que ven el nombre del banco y les resulta mas conocido que Paypal, ejemplo HSBC Mexico, BBVA, esos se que tienen sistema de cobro, con deposito y/o tarjeta de credito.
Asi como es mas sencillo que los clientes confien en bancos del pais, a veces puede ser un verdadero dolor de cabeza implementar las soluciones e incluso superar la burocracia para poder cobrar con esos sistemas.
Pero bueno ahi tienes dos opciones, una totalmente web como Paypal y 2 bancos locales que puedes consultar.
Saludos